Suite à leur intervention lors des Journées Réseaux de l'Enseignement et de la Recherche le 18 mai dernier, Edlira Nano, Olivier Langella et Filippo Rusconi ont publié sur HAL un article dans lequel ils proposent un retour d'expérience sur la mise en pratique des logiciels libres dans la plateforme scientifique "Analyses Protéomiques de Paris Sud-Ouest" (PAPPSO).… Lire la suite Utilisation de logiciels libres dans le cadre d’une plateforme de protéomique, un retour d’expérience positif
Catégorie : Gestion et partage des données et des logiciels
Logiciel libre et recherche publique : rappel de quelques fondamentaux
Qu'est-ce qu'un logiciel libre ? Pourquoi diffuser un logiciel sous licence libre ? Dans un article publié sur CNRS Le journal, Daniel Le Berre, enseignant-chercheur en informatique, rappelle les fondamentaux du logiciel libre. Il rappelle notamment que le monde académique et celui du logiciel libre sont intimement liés : "grâce à la loi pour une… Lire la suite Logiciel libre et recherche publique : rappel de quelques fondamentaux
Le concept de « data authorship » : reconnaître la paternité des données pour encourager leur partage
Les chercheurs sont aujourd’hui largement incités (par les financeurs, les journaux, les institutions…) à partager leurs données. Mais ces données ouvertes ne sont pas (encore) valorisées dans les systèmes d’évaluation comme le sont les articles ou les livres. Un éditorial de Nature publié le 6 avril 2022 estime que « la révolution des données ouvertes… Lire la suite Le concept de « data authorship » : reconnaître la paternité des données pour encourager leur partage
Le logiciel libre au cœur de l’actualité de la science ouverte
Support indispensable à la recherche, le logiciel libre fait parler de lui en ce début d'année 2022. L'ouverture et la promotion des codes sources produits par la recherche sont en effet au cœur du deuxième plan national pour la science ouverte publié en juillet 2021. Conséquence directe de la mise en place de ce plan,… Lire la suite Le logiciel libre au cœur de l’actualité de la science ouverte
Quand partager les données issues des essais cliniques permet de mieux soigner les patients
Dans la série "Les belles histoires de la science ouverte", The Conversation publie un article intitulé "Quand partager les données issues des essais cliniques permet de mieux soigner les patients". Après un rappel sur les étapes nécessaires à la mise en place d'un essai clinique, C. Pellen et F. Naudet (Université de Rennes 1) constatent… Lire la suite Quand partager les données issues des essais cliniques permet de mieux soigner les patients
Big data : l’impact environnemental des données et du numérique
Le mouvement de la science ouverte incite au partage massif des données de la recherche. Le volume de ces données (essentiellement numériques dans le domaine biomédical) ne cesse d'augmenter, notamment avec l'explosion des technologies d'intelligence artificielle. Cependant, toutes ces activités ne sont pas anodines, et, comme le numérique dans sa globalité, ont un impact environnemental… Lire la suite Big data : l’impact environnemental des données et du numérique
Rapport de Knowledge Exchange sur la reproductibilité de la recherche : cinq conclusions à retenir
La reproductibilité et la transparence sont essentiels pour garantir la fiabilité et la qualité de la recherche et faciliter l'exploitation des connaissances existantes. L'ouverture des résultats de la recherche (données, logiciels et publications) en est un élément primordial, même si l'ouverture seule ne garantit pas la reproductibilité. Knowledge Exchange (une collaboration européenne dont on vous… Lire la suite Rapport de Knowledge Exchange sur la reproductibilité de la recherche : cinq conclusions à retenir
Six bonnes raisons de déposer ses données dans un entrepôt
Pourquoi déposer ses données dans un entrepôt de données est-il préférable à l'ajout des données en supplementary data d'un article ? En quoi cela peut-il vous être utile pour votre recherche ? Un article publié sur le blog de PLOS répond à ces questions en vous proposant six bonnes raisons de déposer vos données dans… Lire la suite Six bonnes raisons de déposer ses données dans un entrepôt
Enquête sur le partage des données : les chercheurs ne semblent pas prêts à changer leurs pratiques
L'éditeur PLOS a mené une enquête auprès de 617 chercheurs d'Amérique du Nord et d'Europe sur leurs pratiques et leurs motivations vis-à-vis du partage des données. Pour cela, ils leur ont demandé d'évaluer différentes tâches liées au partage des données, en terme d'importance et de satisfaction quant à leur capacité à les accomplir. L'objectif était… Lire la suite Enquête sur le partage des données : les chercheurs ne semblent pas prêts à changer leurs pratiques
Prix science ouverte des données de recherche et du logiciel libre de la recherche : la France veut mettre en valeur les travaux exemplaires
Comme annoncé dans le deuxième Plan National pour la Science Ouverte, la France a décidé de mettre en valeur les projets et les équipes exemplaires dans différents domaines de la science ouverte en remettant plusieurs prix début février 2022 : Le prix science ouverte données de la recherche récompensera les équipes et projets exemplaires en… Lire la suite Prix science ouverte des données de recherche et du logiciel libre de la recherche : la France veut mettre en valeur les travaux exemplaires