Gestion et partage des données et des logiciels

Reproductibilité de la recherche : participez au workshop à l’Institut Pasteur les 8 et 9 mars prochains

L'Institut Pasteur accueille les 8 et 9 mars prochains un workshop dédié à la problématique de la reproductibilité en recherche. Ce workshop a deux objectifs : Dresser un état des lieux de la reproductibilité en France, en rassemblant des scientifiques de disciplines différentes qui aborderont différentes définitions de la reproductibilité : reproductibilité observationnelle, computationnelle, expérimentale… Lire la suite Reproductibilité de la recherche : participez au workshop à l’Institut Pasteur les 8 et 9 mars prochains

Gestion et partage des données et des logiciels

Partage des codes et des données de la recherche : qu’est-ce qui bloque ?

Dans un long article paru fin novembre, un groupe de travail réuni lors de la réunion inaugurale de la Society for Open, Reproducible, and Transparent Ecology and Evolution identifie les principales barrières, réelles ou supposées, qui retiennent les chercheurs de partager leurs codes et leurs données de recherche. Les bénéfices de ce partage, rappelés en… Lire la suite Partage des codes et des données de la recherche : qu’est-ce qui bloque ?

Gestion et partage des données et des logiciels

Élaborer un plan de gestion de logiciel : un guide pratique à votre disposition

En 2021, nous vous donnions quelques conseils pour mettre en place un plan de gestion de logiciel (PGL), cet outil qui vous aide à adopter de bonnes pratiques de développement et de gestion des logiciels de recherche. En octobre 2022, un groupe de travail néerlandais vient de publier un guide pratique pour l'élaboration de plans… Lire la suite Élaborer un plan de gestion de logiciel : un guide pratique à votre disposition

Gestion et partage des données et des logiciels

Quelle accessibilité sur le long terme pour les données associées aux publications ?

Quand vous trouvez un article intéressant et que vous souhaitez accéder aux données associées, vous allez voir la section Data Availability Statement (DAS) (ou équivalent) de l'article ? Mais les informations dans le DAS suffisent-elles toujours pour accéder aux données ? C'est cette question de l'accessibilité sur le long terme des données, codes et autres… Lire la suite Quelle accessibilité sur le long terme pour les données associées aux publications ?

Gestion et partage des données et des logiciels

Open Science Days du 13 au 15 décembre 2022 : les codes et logiciels au programme

Vous développez des logiciels pour votre recherche ? Vous vous intéressez à la place du logiciel dans l'évaluation des carrières ? Vous vous posez des questions sur les aspects juridiques et la valorisation des codes ? Ou vous souhaitez simplement avoir un aperçu de l’actualité du logiciel libre ? Les Open Science Days organisés du… Lire la suite Open Science Days du 13 au 15 décembre 2022 : les codes et logiciels au programme

Gestion et partage des données et des logiciels

Utilisation de logiciels libres dans le cadre d’une plateforme de protéomique, un retour d’expérience positif

Suite à leur intervention lors des Journées Réseaux de l'Enseignement et de la Recherche le 18 mai dernier, Edlira Nano, Olivier Langella et Filippo Rusconi ont publié sur HAL un article dans lequel ils proposent un retour d'expérience sur la mise en pratique des logiciels libres dans la plateforme scientifique "Analyses Protéomiques de Paris Sud-Ouest" (PAPPSO).… Lire la suite Utilisation de logiciels libres dans le cadre d’une plateforme de protéomique, un retour d’expérience positif

Gestion et partage des données et des logiciels

Logiciel libre et recherche publique : rappel de quelques fondamentaux

Qu'est-ce qu'un logiciel libre ? Pourquoi diffuser un logiciel sous licence libre ? Dans un article publié sur CNRS Le journal, Daniel Le Berre, enseignant-chercheur en informatique, rappelle les fondamentaux du logiciel libre. Il rappelle notamment que le monde académique et celui du logiciel libre sont intimement liés : "grâce à la loi pour une… Lire la suite Logiciel libre et recherche publique : rappel de quelques fondamentaux

Gestion et partage des données et des logiciels

Le concept de « data authorship » : reconnaître la paternité des données pour encourager leur partage

Les chercheurs sont aujourd’hui largement incités (par les financeurs, les journaux, les institutions…) à partager leurs données. Mais ces données ouvertes ne sont pas (encore) valorisées dans les systèmes d’évaluation comme le sont les articles ou les livres. Un éditorial de Nature publié le 6 avril 2022 estime que « la révolution des données ouvertes… Lire la suite Le concept de « data authorship » : reconnaître la paternité des données pour encourager leur partage

Gestion et partage des données et des logiciels

Le logiciel libre au cœur de l’actualité de la science ouverte

Support indispensable à la recherche, le logiciel libre fait parler de lui en ce début d'année 2022. L'ouverture et la promotion des codes sources produits par la recherche sont en effet au cœur du deuxième plan national pour la science ouverte publié en juillet 2021. Conséquence directe de la mise en place de ce plan,… Lire la suite Le logiciel libre au cœur de l’actualité de la science ouverte

Gestion et partage des données et des logiciels

Quand partager les données issues des essais cliniques permet de mieux soigner les patients

Dans la série "Les belles histoires de la science ouverte", The Conversation publie un article intitulé "Quand partager les données issues des essais cliniques permet de mieux soigner les patients". Après un rappel sur les étapes nécessaires à la mise en place d'un essai clinique, C. Pellen et F. Naudet (Université de Rennes 1) constatent… Lire la suite Quand partager les données issues des essais cliniques permet de mieux soigner les patients