Gestion et partage des données et des logiciels

Bientôt un service générique pour l’accueil et la diffusion des données de la recherche française ?

Depuis juin 2020, un groupe de travail du Comité pour la Science Ouverte travaille à la conception d'un service générique destiné à l'accueil et à la diffusion des données simples. Ce groupe de travail vient de publier une étude de faisabilité qui présente et évalue différents scénarios, niveaux d’ambition fonctionnels et modalités d’implémentation. Il s'agit… Lire la suite Bientôt un service générique pour l’accueil et la diffusion des données de la recherche française ?

Comment faire

Comment trouver un entrepôt de données dans le domaine biomédical ?

Pour partager ses données à un large public, la solution la plus efficace est de les déposer dans un entrepôt de données (on vous explique ce que c'est ici). Mais comment trouver l'entrepôt le plus adapté à sa thématique de recherche ? Vous pouvez d'abord consulter la liste d’entrepôts dans le domaine biomédical proposée par… Lire la suite Comment trouver un entrepôt de données dans le domaine biomédical ?

On vous explique

Les entrepôts de données

Les entrepôts de données de recherche sont des services en ligne permettant la collecte, la description, la conservation, la recherche et la diffusion des données scientifiques. En déposant ses données sur un entrepôt, un scientifique peut ainsi : Rendre ses données faciles à trouver et accessibles sur le long terme, via une interface web et… Lire la suite Les entrepôts de données

Comment faire

Comment déposer facilement des données de séquence dans la base de données European Nucleotide Archive ?

ELIXIR, organisation intergouvernementale rassemblant les infrastructures et ressources en sciences de la vie en Europe, propose aux chercheurs un nouvel outil simplifiant le dépôt de séquences virales dans la base de données European Nucleotide Archive (ENA). Ce nouvel outil permet à tous les chercheurs de déposer facilement leurs séquences dans ENA sans avoir de connaissances… Lire la suite Comment déposer facilement des données de séquence dans la base de données European Nucleotide Archive ?

Gestion et partage des données et des logiciels

Le projet RESOLUTE propose une recette pour FAIRifier les données transcriptomiques et faciliter leur dépôt dans les bases de données

Comment et pourquoi "FAIRifier" ses données pour les rendre Faciles à trouver, Accessibles, Interopérables et Réutilisables ? Le projet RESOLUTE s'est posé ces questions concernant leurs données transcriptomiques, protéomiques et métabolomiques : Pourquoi ? En premier lieu, pour pouvoir facilement soumettre les données dans des entrepôts, comme European Nucleotide Archive (ENA), ProteomeXchange ou Metabolights. Comment… Lire la suite Le projet RESOLUTE propose une recette pour FAIRifier les données transcriptomiques et faciliter leur dépôt dans les bases de données

Gestion et partage des données et des logiciels

Focus on a few data repositories that are growing in importance with the COVID-19 crisis

Since the start of the COVID-19 outbreak, laboratories around the world have been generating a huge amount of data. The timely sharing of research data plays a critical role in advancing the understanding of COVID-19 and accelerating the pace of discovery. In this context, some data repositories are growing in importance and some have experienced an… Lire la suite Focus on a few data repositories that are growing in importance with the COVID-19 crisis

Gestion et partage des données et des logiciels

How to choose a data repository? A list of criteria to help you

Publishers and journals are more and more requiring datasets to be deposited and made accessible via repositories. However, with thousands of options available, choosing a data repository is becoming extremely difficult. FAIRsharing, DataCite and a group of publishers have joined forces to propose a set of 7 essential criteria and 11 desirable criteria that journals… Lire la suite How to choose a data repository? A list of criteria to help you

Gestion et partage des données et des logiciels

FAIRness of repositories and their data

LIBER’s Research Data Management Working Group carried out two data repositories surveys. The responses for both questionnaires have been merged and analyzed to gain a comprehensive picture about FAIRness at the level of repositories and their data. The report, which can be downloaded from Zenodo, summarises the answers given by managers, librarians and technical staff… Lire la suite FAIRness of repositories and their data

Gestion et partage des données et des logiciels

GeRDI: A Generic Research Data Infrastructure for Long Tail Research Data Management

Abstract The advent of data intensive science has fueled the generation of digital scientific data. Undoubtedly, digital research data plays a pivotal role in transparency and re-producibility of scientific results as well as in steering the innovation in a research process. However, the main challenges for science policy and infrastructure projects are to develop practices and… Lire la suite GeRDI: A Generic Research Data Infrastructure for Long Tail Research Data Management

Gestion et partage des données et des logiciels

Data Inra: How Europe’s top agricultural research institute, INRA, uses Dataverse to improve data sharing

L'Institut national de la recherche agronomique (INRA), or the French National Institute for Agricultural Research, updated their Dataverse-based repository in late January 2019. This repository, called Portail Data Inra, is used as an institutional data repository and a data registry. Indeed, it is possible to keep the data in the original places and create datasets in… Lire la suite Data Inra: How Europe’s top agricultural research institute, INRA, uses Dataverse to improve data sharing