DataMed est un prototype de moteur de recherche de données scientifiques dans le domaine biomédical. Financé par le NIH dans le cadre du projet BioCADDIE, ce moteur de recherche open source facilite la découverte de données de recherche, en permettant, en une seule requête, de chercher dans un large spectre d'entrepôts de données en sciences… Lire la suite DataMed
Étiquette : Réutilisation des données
Comment organiser et nommer ses données ?
[Mise à jour d’un article initialement publié en avril 2021] Vous est-il déjà arrivé d'ouvrir un dossier partagé avec vos collègues sans parvenir à mettre la main sur les données que vous cherchiez ? Avez-vous déjà été confronté à cette même problématique en ouvrant un vieux disque dur contenant vos propres données ? "Les données… Lire la suite Comment organiser et nommer ses données ?
GISAID : un avenir incertain ?
Dans un article paru le 19 avril dernier dans la revue Science, Martin Enserink (rédacteur en chef adjoint de la revue) et Jon Cohen (journaliste scientifique) s'inquiètent pour l'avenir de GISAID, la base de données des génomes des virus de la grippe, devenue une base de données de référence pour le SARS-CoV-2. En effet, certains… Lire la suite GISAID : un avenir incertain ?
Accéder à des données sensibles ou confidentielles, c’est possible sous conditions
Pour mener à bien votre projet de recherche, vous pourriez avoir besoin d'accéder à des données sensibles ou confidentielles, comme des données de santé ou des données protégées par le secret statistique. Plusieurs actualités récentes détaillent comment et dans quelles conditions il est possible d'y accéder. En voici une petite compilation. Comment accéder à des… Lire la suite Accéder à des données sensibles ou confidentielles, c’est possible sous conditions
Quelle accessibilité sur le long terme pour les données associées aux publications ?
Quand vous trouvez un article intéressant et que vous souhaitez accéder aux données associées, vous allez voir la section Data Availability Statement (DAS) (ou équivalent) de l'article ? Mais les informations dans le DAS suffisent-elles toujours pour accéder aux données ? C'est cette question de l'accessibilité sur le long terme des données, codes et autres… Lire la suite Quelle accessibilité sur le long terme pour les données associées aux publications ?
Comment connaître les questions juridiques à se poser avant de réutiliser ou diffuser des données ?
Les scientifiques sont encouragés à réutiliser des données existantes avant de créer leurs propres données, et à partager leurs données selon le principe « aussi ouvert que possible, aussi fermé que nécessaire ». Ce principe fait référence au fait que, pour des raisons réglementaires, légales ou contractuelles, certaines données ne peuvent pas être librement diffusées.… Lire la suite Comment connaître les questions juridiques à se poser avant de réutiliser ou diffuser des données ?
Le concept de « data authorship » : reconnaître la paternité des données pour encourager leur partage
Les chercheurs sont aujourd’hui largement incités (par les financeurs, les journaux, les institutions…) à partager leurs données. Mais ces données ouvertes ne sont pas (encore) valorisées dans les systèmes d’évaluation comme le sont les articles ou les livres. Un éditorial de Nature publié le 6 avril 2022 estime que « la révolution des données ouvertes… Lire la suite Le concept de « data authorship » : reconnaître la paternité des données pour encourager leur partage
Quand partager les données issues des essais cliniques permet de mieux soigner les patients
Dans la série "Les belles histoires de la science ouverte", The Conversation publie un article intitulé "Quand partager les données issues des essais cliniques permet de mieux soigner les patients". Après un rappel sur les étapes nécessaires à la mise en place d'un essai clinique, C. Pellen et F. Naudet (Université de Rennes 1) constatent… Lire la suite Quand partager les données issues des essais cliniques permet de mieux soigner les patients
Enquête sur le partage des données : les chercheurs ne semblent pas prêts à changer leurs pratiques
L'éditeur PLOS a mené une enquête auprès de 617 chercheurs d'Amérique du Nord et d'Europe sur leurs pratiques et leurs motivations vis-à-vis du partage des données. Pour cela, ils leur ont demandé d'évaluer différentes tâches liées au partage des données, en terme d'importance et de satisfaction quant à leur capacité à les accomplir. L'objectif était… Lire la suite Enquête sur le partage des données : les chercheurs ne semblent pas prêts à changer leurs pratiques
Prix science ouverte des données de recherche et du logiciel libre de la recherche : la France veut mettre en valeur les travaux exemplaires
Comme annoncé dans le deuxième Plan National pour la Science Ouverte, la France a décidé de mettre en valeur les projets et les équipes exemplaires dans différents domaines de la science ouverte en remettant plusieurs prix début février 2022 : Le prix science ouverte données de la recherche récompensera les équipes et projets exemplaires en… Lire la suite Prix science ouverte des données de recherche et du logiciel libre de la recherche : la France veut mettre en valeur les travaux exemplaires