Dans une lettre à l'éditeur publiée dans Nature mental health, trois chercheurs, chinois et iranien, dénoncent les inégalités d'accès à certaines bases de données en santé mentale, malgré les promesses affichées de partage de données. En effet, lorsqu'ils ont tenté d'accéder à des bases de données en santé mentale dans le cadre de leur recherche,… Lire la suite Inégalités d’accès aux bases de données humaines : un écart entre la promesse de partage des données et leur accessibilité pratique
Étiquette : Réutilisation des données
Comment citer un jeu de données ou un logiciel dans ses publications ?
[Mise à jour d'un article initialement publié en avril 2021] Vous avez trouvé un jeu de données intéressant dans un entrepôt et vous l’avez réutilisé pour produire un résultat scientifique ? Vous avez généré des données à l'aide d'un logiciel développé par d’autres scientifiques ? Dans ce cas, il est important de citer de manière… Lire la suite Comment citer un jeu de données ou un logiciel dans ses publications ?
Comment trouver des données et composants logiciels à réutiliser ?
[Mise à jour d’un article initialement publié en juin 2021] Avant de générer des données ou de développer un logiciel, il est toujours utile de vérifier s’il n’est pas possible de réutiliser des jeux de données ou des composants logiciels produits par d’autres scientifiques, et ce afin d'éviter la duplication des efforts. Voici donc quelques… Lire la suite Comment trouver des données et composants logiciels à réutiliser ?
DataMed
DataMed est un prototype de moteur de recherche de données scientifiques dans le domaine biomédical. Financé par le NIH dans le cadre du projet BioCADDIE, ce moteur de recherche open source facilite la découverte de données de recherche, en permettant, en une seule requête, de chercher dans un large spectre d'entrepôts de données en sciences… Lire la suite DataMed
Comment organiser et nommer ses données ?
[Mise à jour d’un article initialement publié en avril 2021] Vous est-il déjà arrivé d'ouvrir un dossier partagé avec vos collègues sans parvenir à mettre la main sur les données que vous cherchiez ? Avez-vous déjà été confronté à cette même problématique en ouvrant un vieux disque dur contenant vos propres données ? "Les données… Lire la suite Comment organiser et nommer ses données ?
GISAID : un avenir incertain ?
Dans un article paru le 19 avril dernier dans la revue Science, Martin Enserink (rédacteur en chef adjoint de la revue) et Jon Cohen (journaliste scientifique) s'inquiètent pour l'avenir de GISAID, la base de données des génomes des virus de la grippe, devenue une base de données de référence pour le SARS-CoV-2. En effet, certains… Lire la suite GISAID : un avenir incertain ?
Accéder à des données sensibles ou confidentielles, c’est possible sous conditions
Pour mener à bien votre projet de recherche, vous pourriez avoir besoin d'accéder à des données sensibles ou confidentielles, comme des données de santé ou des données protégées par le secret statistique. Plusieurs actualités récentes détaillent comment et dans quelles conditions il est possible d'y accéder. En voici une petite compilation. Comment accéder à des… Lire la suite Accéder à des données sensibles ou confidentielles, c’est possible sous conditions
Quelle accessibilité sur le long terme pour les données associées aux publications ?
Quand vous trouvez un article intéressant et que vous souhaitez accéder aux données associées, vous allez voir la section Data Availability Statement (DAS) (ou équivalent) de l'article ? Mais les informations dans le DAS suffisent-elles toujours pour accéder aux données ? C'est cette question de l'accessibilité sur le long terme des données, codes et autres… Lire la suite Quelle accessibilité sur le long terme pour les données associées aux publications ?
Comment connaître les questions juridiques à se poser avant de réutiliser ou diffuser des données ?
Les scientifiques sont encouragés à réutiliser des données existantes avant de créer leurs propres données, et à partager leurs données selon le principe « aussi ouvert que possible, aussi fermé que nécessaire ». Ce principe fait référence au fait que, pour des raisons réglementaires, légales ou contractuelles, certaines données ne peuvent pas être librement diffusées.… Lire la suite Comment connaître les questions juridiques à se poser avant de réutiliser ou diffuser des données ?
Le concept de « data authorship » : reconnaître la paternité des données pour encourager leur partage
Les chercheurs sont aujourd’hui largement incités (par les financeurs, les journaux, les institutions…) à partager leurs données. Mais ces données ouvertes ne sont pas (encore) valorisées dans les systèmes d’évaluation comme le sont les articles ou les livres. Un éditorial de Nature publié le 6 avril 2022 estime que « la révolution des données ouvertes… Lire la suite Le concept de « data authorship » : reconnaître la paternité des données pour encourager leur partage