Nous vous expliquions précédemment ce qu'est un article exécutable, cette publication interactive qui combine texte, données et code. Mais comment faire pour publier ce type d'article ? Avant toute chose, il faut bien noter que ce type de publication est uniquement adapté à la recherche qui s'appuie sur du code informatique. Si vous êtes dans… Lire la suite Comment publier un article exécutable ?
Étiquette : Reproductibilité
Les documents computationnels ou notebooks
Inclure du code informatique dans sa démarche scientifique est désormais le quotidien d'un grand nombre de chercheurs. Les documents computationnels (ou notebooks) qui permettent d’intégrer dans un même document du texte, du code et des résultats, ont donc gagné en popularité. Zoom sur ces documents qui permettent une recherche plus transparente et plus reproductible. Les… Lire la suite Les documents computationnels ou notebooks
La revue Nature adopte un nouveau format de publication : les Registered Reports
Dans un éditorial publié le 22 février dernier, la revue Nature annonce qu'elle publiera désormais des Registered Reports (RR), un nouveau format de publication dont nous vous parlions ici et ici. L'éditorial explique cette décision : "En partie pour tenter de réduire les biais de publication, c'est-à-dire la tendance du système de recherche (...) à… Lire la suite La revue Nature adopte un nouveau format de publication : les Registered Reports
Reproductibilité de la recherche : participez au workshop à l’Institut Pasteur les 8 et 9 mars prochains
L'Institut Pasteur accueille les 8 et 9 mars prochains un workshop dédié à la problématique de la reproductibilité en recherche. Ce workshop a deux objectifs : Dresser un état des lieux de la reproductibilité en France, en rassemblant des scientifiques de disciplines différentes qui aborderont différentes définitions de la reproductibilité : reproductibilité observationnelle, computationnelle, expérimentale… Lire la suite Reproductibilité de la recherche : participez au workshop à l’Institut Pasteur les 8 et 9 mars prochains
Comment publier un Registered Report ?
Il y a quelques mois nous vous parlions des Registered Reports (RR) comme un moyen de réduire les biais de publication et améliorer la qualité et la reproductibilité des études. Mais comment faire concrètement pour en publier un ? 1) Trouver une revue qui publie des Registered Reports Aujourd'hui, plus de 300 journaux proposent de… Lire la suite Comment publier un Registered Report ?
Le cahier de laboratoire électronique, un outil au service de la science reproductible
Le cahier de laboratoire électronique (ou ELN pour Electronic Lab Notebook) est un journal de bord utilisé pour détailler au quotidien les activités de recherche : description des protocoles, des expériences, des résultats obtenus... Il permet donc de garantir la traçabilité et la reproductibilité des données et des résultats de recherche. De plus, il s'agit… Lire la suite Le cahier de laboratoire électronique, un outil au service de la science reproductible
Les articles exécutables
Qui n'a jamais eu envie de modifier un graphique dans une publication (pour changer d'échelle, enlever une variable...) ou d'accéder aux données brutes et au code qui ont permis de créer ce graphique ? C'est désormais possible avec les articles exécutables (Executable Research Articles ou Executable papers). Dans ce nouveau format de publication, la publication… Lire la suite Les articles exécutables
Les chercheurs seniors peuvent jouer un rôle dans la transition vers la science ouverte
Un commentaire paru dans BMC Research Notes met l'accent sur le rôle des chercheurs seniors dans la transition vers une recherche ouverte et reproductible. Le texte se focalise particulièrement sur 3 conseils que les chercheurs seniors peuvent mettre en œuvre pour encourager la recherche ouverte mais également améliorer la qualité et la productivité de leur… Lire la suite Les chercheurs seniors peuvent jouer un rôle dans la transition vers la science ouverte
Les Registered Reports
Course à la publication "Publish or Perish", invisibilisation d’une partie de la science, faible reproductibilité des résultats.... Quelle solution pour faire face à ces nombreuses dérives ? Le modèle de publication Registered Reports (RR) pourrait bien changer la donne. Proposée en 2012, cette nouvelle forme de publication change la façon dont les revues sélectionnent les… Lire la suite Les Registered Reports
Comment décrire ses données pour les rendre compréhensibles et réutilisables ?
Vous êtes-vous déjà retrouvé dans la situation d'être incapable de décrire précisément un jeu de données, par exemple au moment où vous souhaitez le partager ou le publier sur un entrepôt ? Il est tout à fait normal de ne pas se souvenir des détails sur des données, plusieurs mois ou années après les avoir… Lire la suite Comment décrire ses données pour les rendre compréhensibles et réutilisables ?