Vous cherchez un entrepôt de données pour partager vos données multi-omiques ? Retrouvez sur la plateforme DORANum une ressource pédagogique présentant une sélection d’entrepôts de confiance dédiés à ce type de données. Ces entrepôts ont été identifiés par le Collège des données de la recherche du Comité pour la science ouverte, selon une méthodologie dont nous vous parlions ici.
Cette ressource vous présente quatre entrepôts, sous forme de fiches d’informations :
- ArrayExpress, pour les données génomiques fonctionnelles à haut débit issues de puces à ADN ou de séquençage de nouvelle génération ;
- European Nucleotide Archive (ENA), pour les séquences nucléotidiques ;
- European Genome-phenome Archive (EGA), pour les données génétiques, phénotypiques et cliniques comportant des données à caractère personnel et nécessitant un contrôle d’accès ;
- Genetic and Genomic Information System (GnpIS), pour les données en agronomie (ressources génétiques, polymorphismes et données de génotypage, données de phénotypage, données d’association, cartes génétiques et QTL, données de synténie).
Sur chaque fiche, vous trouverez des informations sur :
- les données acceptées ;
- l’institution porteuse ;
- le type d’identifiant attribué aux jeux de données ;
- le schéma de métadonnées utilisé ;
- le type de modération effectué ;
- la pérennité de l’infrastructure ;
- la possibilité d’appliquer un embargo pendant lequel les données restent en accès privé ;
- les limites de volume.
Vous trouverez également sur cette page d’autres entrepôts en biologie identifiés comme « entrepôts de confiance ». Cette liste ne couvre pas encore tous les champs disciplinaires mais elle a vocation à être progressivement complétée.
Source : Institut de l’Information Scientifique et Technique, de Lamotte, F., & Chiapello, H. (2026). DoRANum-Bio-informatique : Les entrepôts de données adaptés aux données multi-omics. DoRANum. https://doi.org/10.13143/TFEA-AJ46
