En novembre 2025, l'organisation ELIXIR publiait un rapport soulignant la contribution des logiciels et des workflows open source à l'innovation dans le domaine des sciences de la vie. Ce rapport comprend notamment une analyse qualitative basée sur quinze entretiens avec des représentants d'entreprises de bioinformatique. Les personnes interrogées mentionnent plusieurs raisons pour lesquelles une entreprise peut… Lire la suite Comment les logiciels open source contribuent-ils à l’innovation ? Analyse des pratiques de 15 entreprises de bioinformatique
Étiquette : Logiciel libre
rOpenSci Champions : pour une science ouverte, multilingue et portée par les logiciels libres
[Version espagnole accessible ici : « rOpenSci Champions: por una ciencia abierta, multilingüe y basada en software libre »] Beaucoup de résultats scientifiques s’appuient sur des codes et logiciels développés par les chercheurs. L’ouverture de ces outils, scripts ou packages statistiques est essentielle pour garantir la reproductibilité et la transparence de la recherche. Leur ouverture… Lire la suite rOpenSci Champions : pour une science ouverte, multilingue et portée par les logiciels libres
rOpenSci Champions: por una ciencia abierta, multilingüe y basada en software libre
[Version espagnole de l’article « rOpenSci Champions : pour une science ouverte, multilingue et portée par les logiciels libres »] Muchos resultados científicos dependen de códigos y programas desarrollados por los investigadores. Que estas herramientas, scripts o paquetes estadísticos sean abiertos resulta esencial para garantizar la transparencia y la reproducibilidad de la investigación. Además, liberarlos… Lire la suite rOpenSci Champions: por una ciencia abierta, multilingüe y basada en software libre
Lancement d’un nouveau catalogue pour mettre en lumière les logiciels libres développés dans la recherche académique
Nous vous parlions en décembre dernier de la publication d'un rapport préalable au développement d'un catalogue des logiciels développés dans les laboratoires de recherche français. Mi-avril, le collège « Codes sources et logiciels » du comité pour la science ouverte a annoncé que ce catalogue existe désormais, en version bêta. Le portail de ce catalogue… Lire la suite Lancement d’un nouveau catalogue pour mettre en lumière les logiciels libres développés dans la recherche académique
Mastodon
Développé par Eugen Rochko en 2016, Mastodon est un logiciel de microblog présenté par son concepteur comme une « alternative viable à Twitter ». A tel point que l’on a peut-être trop réduit ce réseau social à sa capacité à séduire (ou pas) les déçus de X / Twitter. Les fonctionnalités familières d’un site de… Lire la suite Mastodon
Comment trouver des données et composants logiciels à réutiliser ?
[Mise à jour d’un article initialement publié en juin 2021] Avant de générer des données ou de développer un logiciel, il est toujours utile de vérifier s’il n’est pas possible de réutiliser des jeux de données ou des composants logiciels produits par d’autres scientifiques, et ce afin d'éviter la duplication des efforts. Voici donc quelques… Lire la suite Comment trouver des données et composants logiciels à réutiliser ?
Ouverture des candidatures pour les prix science ouverte 2024 : logiciel libre, données de la recherche et thèse
Depuis 2022, le ministère de l’Enseignement supérieur et de la Recherche remet les prix science ouverte aux projets qui se distinguent par leurs pratiques de la science ouverte. Deux prix étaient jusque-là décernés, l'un concernant les logiciels libres, l'autre concernant les données de la recherche. Cette année, une troisième catégorie fait son apparition : le… Lire la suite Ouverture des candidatures pour les prix science ouverte 2024 : logiciel libre, données de la recherche et thèse
On a adoré : Ada & Zangemann. Un conte sur les logiciels, le skateboard et la glace à la framboise
"Ada & Zangemann. Un conte sur les logiciels, le skateboard et la glace à la framboise" a tout pour plaire. C'est tout d'abord un livre illustré très agréable avec un récit très bien construit, le premier du genre à aborder la thématique des logiciels libres et du numérique en général. Petits et grands ne pourront… Lire la suite On a adoré : Ada & Zangemann. Un conte sur les logiciels, le skateboard et la glace à la framboise
Comment déposer son code logiciel dans HAL ?
[Mise à jour d’un article initialement publié en janvier 2021] Les scientifiques développant des composants logiciels (scripts, programmes ou workflows) sont encouragés à rendre public leur code source. Cependant, un code logiciel est par nature évolutif et peut comprendre de multiples versions. Il peut donc être utile de rendre disponible et citable une certaine version… Lire la suite Comment déposer son code logiciel dans HAL ?
Déposez votre candidature pour le prix science ouverte du logiciel libre de la recherche 2023
Décerné depuis 2022, le prix science ouverte du logiciel libre de la recherche a pour objectif d’accroître la visibilité et la reconnaissance des logiciels comme contribution à la recherche et de récompenser les équipes qui réalisent un travail exemplaire dans ce domaine. Il valorise des projets qui œuvrent au développement et à la diffusion des… Lire la suite Déposez votre candidature pour le prix science ouverte du logiciel libre de la recherche 2023