Dans le mouvement pour la Science Ouverte, un type de document reste peu exploité : le protocole de recherche ou Lab Protocol. Pourtant son partage permettrait d’améliorer grandement la reproductibilité de la recherche. Nous vous proposons donc aujourd’hui un récapitulatif des raisons pour lesquelles il est intéressant de publier son protocole, ainsi que des façons de procéder.
Plusieurs raisons pourraient vous inciter à publier vos protocoles :
- Assurer la transparence des méthodes que vous utilisez et favoriser la reproductibilité de vos résultats,
- Permettre aux autres scientifiques de citer facilement vos méthodes et de vous créditer,
- Encourager le dialogue et les échanges sur vos méthodes, ce qui peut permettre d’affiner les protocoles,
- Favoriser la réutilisation des protocoles, réduisant ainsi les efforts et les dépenses inutiles pour établir un nouveau protocole alors qu’il en existe déjà un qui a fait ses preuves,
- Faciliter la gestion et la transmission des protocoles au sein des membres de votre laboratoire.
Si une ou plusieurs de ces raisons vous ont décidé, vous vous demandez peut-être comment faire. Il existe plusieurs façons de partager son protocole :
- directement sur le site web de votre unité (des exemples ici et ici),
- dans un entrepôt, comme protocols.io, Open Science Framework ou Zenodo,
- dans un journal à comité de lecture, comme bio-protocol, MethodsX (revues full Open Access), Current Protocols, JoVE, Nature Methods, Nature Protocols (revues hybrides), CSH Protocols (revue dans laquelle les articles sont en accès gratuit).
Dans le cas de la publication d’un article de recherche classique, vous pourriez être tenté d’ajouter votre protocole sous forme de fichier supplémentaire. Nous vous conseillons d’éviter cette solution et de privilégier le dépôt de votre protocole dans un entrepôt. Pourquoi ?
- Pour vous permettre de gérer facilement les différentes versions de votre protocole,
- Pour assurer la pérennité de l’accès à votre protocole : les URL pérennes attribuées par les entrepôts sont plus fiables que les URL des fichiers supplémentaires qui sont fréquemment brisées,
- Pour que votre protocole soit plus facilement trouvable via des moteurs de recherche et donc plus facilement réutilisable,
- Pour faciliter la citation de votre protocole à l’aide du bouton « How to Cite » généralement proposé par les entrepôts.
Voir aussi : Love Methods Week: Best practices for sharing protocols to maximize credit and reuse, webinaire présenté par Lenny Teytelman, président et fondateur de protocols.io.
