Le Réseau français de la recherche reproductible est une initiative nationale informelle qui rassemble des scientifiques engagés dans l’étude des facteurs favorisant la reproductibilité de la recherche. Bien que les enjeux de la reproductibilité varient selon les disciplines, ils concernent l’ensemble des domaines scientifiques. Le réseau s’attache ainsi à représenter une diversité disciplinaire riche et… Lire la suite Le Réseau français de la recherche reproductible vous donne rendez-vous les 3 et 4 avril 2025 à Lyon pour son colloque annuel
Étiquette : Reproductibilité
Analyse de la littérature scientifique sur les notebooks : des usages variés mais une reproductibilité limitée
Nous vous présentions précédemment les notebooks (ou documents computationnels), dont l'utilisation est censée améliorer la reproductibilité de la recherche. Mais est-ce vraiment le cas ? Et plus globalement, quelles sont les pratiques actuelles autour des notebooks ? C'est ce que les auteurs de l'article Notebook and Open science : toward more FAIR play publié en… Lire la suite Analyse de la littérature scientifique sur les notebooks : des usages variés mais une reproductibilité limitée
Comment décrire ses données pour les rendre compréhensibles et réutilisables ?
[Mise à jour d’un article initialement publié en février 2022] Mettre des données de recherche à disposition de la communauté scientifique ou les préserver sur le long terme : des bonnes pratiques qui ne servent à rien si les données ne sont pas compréhensibles. Décrire les données et documenter leur contexte de création est donc… Lire la suite Comment décrire ses données pour les rendre compréhensibles et réutilisables ?
Un nouveau MOOC sur la recherche reproductible pour améliorer vos pratiques de gestion de données massives et de calculs
Pour travailler de manière reproductible, il est nécessaire de connaître des méthodes efficaces ainsi que des outils, d'autant plus lorsque l'on travaille avec de gros volumes de données et des calculs complexes. Avec le nouveau MOOC "Reproducible Research II: Practices and tools for managing computations and data" vous devriez avoir toutes les cartes en main… Lire la suite Un nouveau MOOC sur la recherche reproductible pour améliorer vos pratiques de gestion de données massives et de calculs
Comment choisir une forme de publication permettant de rendre sa recherche plus transparente et reproductible ?
Lorsque l'on publie un article de recherche "classique", on raconte une jolie histoire, qui comprend généralement uniquement des résultats positifs et ne présente qu'une petite partie du travail effectué. Si l'on regarde la partie immergée de l'iceberg, on y trouve des tentatives, des échecs, des données, des codes, des calculs, des analyses, des résultats négatifs...… Lire la suite Comment choisir une forme de publication permettant de rendre sa recherche plus transparente et reproductible ?
Les Lab Protocols
Un Lab Protocol, également appelé Laboratory Protocol ou Method Article, est une publication scientifique qui détaille pas à pas la méthodologie utilisée lors d'un travail de recherche, généralement dans le domaine des sciences de la vie. Le Lab Protocol fournit des instructions détaillées pour la réalisation des expériences et procédures expérimentales : étapes à suivre,… Lire la suite Les Lab Protocols
Comment publier un article exécutable ?
Nous vous expliquions précédemment ce qu'est un article exécutable, cette publication interactive qui combine texte, données et code. Mais comment faire pour publier ce type d'article ? Avant toute chose, il faut bien noter que ce type de publication est uniquement adapté à la recherche qui s'appuie sur du code informatique. Si vous êtes dans… Lire la suite Comment publier un article exécutable ?
Les documents computationnels ou notebooks
Inclure du code informatique dans sa démarche scientifique est désormais le quotidien d'un grand nombre de chercheurs. Les documents computationnels (ou notebooks) qui permettent d’intégrer dans un même document du texte, du code et des résultats, ont donc gagné en popularité. Zoom sur ces documents qui permettent une recherche plus transparente et plus reproductible. Les… Lire la suite Les documents computationnels ou notebooks
La revue Nature adopte un nouveau format de publication : les Registered Reports
Dans un éditorial publié le 22 février dernier, la revue Nature annonce qu'elle publiera désormais des Registered Reports (RR), un nouveau format de publication dont nous vous parlions ici et ici. L'éditorial explique cette décision : "En partie pour tenter de réduire les biais de publication, c'est-à-dire la tendance du système de recherche (...) à… Lire la suite La revue Nature adopte un nouveau format de publication : les Registered Reports
Reproductibilité de la recherche : participez au workshop à l’Institut Pasteur les 8 et 9 mars prochains
L'Institut Pasteur accueille les 8 et 9 mars prochains un workshop dédié à la problématique de la reproductibilité en recherche. Ce workshop a deux objectifs : Dresser un état des lieux de la reproductibilité en France, en rassemblant des scientifiques de disciplines différentes qui aborderont différentes définitions de la reproductibilité : reproductibilité observationnelle, computationnelle, expérimentale… Lire la suite Reproductibilité de la recherche : participez au workshop à l’Institut Pasteur les 8 et 9 mars prochains