[Mise à jour d’un article initialement publié en octobre 2020]
Les principes FAIR (que nous vous expliquions ici) peuvent être utilisés comme un guide de bonnes pratiques pour améliorer la découverte et la réutilisation des données. Pour répondre à une grande partie de ces principes, le plus simple est de déposer ses données dans un entrepôt de données.
Il est donc indispensable de choisir un entrepôt qui permet d’atteindre un niveau suffisant de « FAIRisation » des données :
– Si vos données ne peuvent pas être rendues publiques, il vous faut choisir un entrepôt adapté pour des données en accès restreint, permettant d’en contrôler l’accès : vous pourrez ainsi signaler l’existence de vos données en rendant accessibles uniquement les métadonnées et en laissant la possibilité de faire une demande d’accès aux fichiers (exemple : l’entrepôt European Genome-phenome Archive).
– Il est conseillé de choisir un entrepôt qui attribue des identifiants uniques et pérennes (DOI, PURL, ARK, Handle…). Pour le savoir, vous pouvez chercher l’entrepôt dans le répertoire re3data, regarder si la 4e icône est bleue et consulter l’onglet Standards pour connaître le type d’identifiant attribué (exemple : l’entrepôt ImmPort attribue des DOI).
– Bien que ce soit une information plus difficile à trouver, il est également préconisé de choisir un entrepôt qui suit un standard de métadonnées et utilise des vocabulaires standards dans votre communauté. Pour cela, vous pouvez chercher l’entrepôt dans le répertoire FAIRsharing, et consulter l’onglet Related Standards qui indique les standards de métadonnées, ontologies et formats standards mis en œuvre par l’entrepôt (exemple : l’entrepôt Image Data Resource suit le standard REMBI et utilise plusieurs ontologies).
Certaines bonnes pratiques liées aux principes FAIR ne dépendent que de vous :
– Pour des données en accès restreint, bien préciser les conditions d’accès aux fichiers : qui a le droit d’accéder aux données, comment et sous quel délai. Pour les données en accès ouvert, bien choisir la licence de diffusion à associer à vos jeux de données.
– Décrire vos données de façon précise avec des métadonnées et de la documentation, en donnant le plus d’informations contextuelles possible sur les données, par exemple : la méthode de production des données, la version du logiciel utilisé, le paramétrage des instruments de mesure, le nom des variables…
– Ajouter des liens vers des ressources complémentaires (données, documentation, publications…) dans les métadonnées.
– Privilégier les formats de fichiers ouverts ou largement utilisés. Les formats ouverts, à l’inverse des formats propriétaires, sont interopérables : une donnée enregistrée dans ce type de format est indépendante du logiciel utilisé pour la créer ; elle pourra être lue et modifiée par tous les logiciels destinés à traiter ce type de fichier.
– Si les données ne peuvent être lues, traitées ou analysées que par un logiciel développé en interne, mettre à disposition son code source et le documenter.
Ressource utilisée pour la mise à jour de cet article :
Institut de l’Information Scientifique et Technique, Albaret, L., Bage, A.-S., Caporali, A., Lemeltier, D., MARINI, J., & Moreau, E. (2024). DoRANum-Enjeux et bénéfices : Le Minimum à FAIR. DoRANum. https://doi.org/10.13143/P4WF-4J63
