[Mise à jour d'un article initialement publié en septembre 2022] Vous êtes en train de soumettre un article à une revue et on vous demande de partager les données associées ? Quelles solutions s'offrent à vous et comment faire ? La première étape consiste à identifier les données qu’il est nécessaire d'associer à votre publication.… Lire la suite Comment partager des données associées à une publication ?
Étiquette : Open Data
Déposer des données dans un entrepôt, que doit-on anticiper ? L’exemple de GEO
En décembre dernier, la chercheuse Isabelle Stévant a publié un article intitulé "Chronique d'une soumission de données à GEO" sur le blog participatif de bioinformatique francophone, Bioinfo-fr.net. Cet article illustre étape par étape le processus de dépôt de données de séquençage haut débit dans l'entrepôt Gene Expression Omnibus (GEO). Au-delà de son utilité directe pour… Lire la suite Déposer des données dans un entrepôt, que doit-on anticiper ? L’exemple de GEO
Une histoire de rétractation, ou comment l’open data a permis de détecter des anomalies dans des données
Kate Laskowski, chercheuse en écologie comportementale à l'UC Davis, était invitée à la conférence 2024 de la Society for Open, Reliable, and Transparent Ecology and Evolutionary Biology (SORTEE) pour raconter le processus qui l'a menée à rétracter trois articles. Son intervention vidéo intitulée What to do when you don’t trust your data anymore est très… Lire la suite Une histoire de rétractation, ou comment l’open data a permis de détecter des anomalies dans des données
Matilda
Matilda est un moteur de recherche académique multidisciplinaire basé sur des données ouvertes et sur un logiciel open-source. Son objectif est de faciliter l'accès et l'utilisation des données de références et de citations. Il ne s'agit pas d'une base de données bibliométriques permettant de réaliser des analyses poussées (les données de citations restent à améliorer,… Lire la suite Matilda
Comment trouver des données et composants logiciels à réutiliser ?
[Mise à jour d’un article initialement publié en juin 2021] Avant de générer des données ou de développer un logiciel, il est toujours utile de vérifier s’il n’est pas possible de réutiliser des jeux de données ou des composants logiciels produits par d’autres scientifiques, et ce afin d'éviter la duplication des efforts. Voici donc quelques… Lire la suite Comment trouver des données et composants logiciels à réutiliser ?
Wikidata
Wikidata est partout et vous ne le savez peut-être pas ! A ce jour, la base de connaissance libre est composée de plus de 110 millions d'éléments de données que tout un chacun peut enrichir. Née en 2012, Wikidata est depuis devenue l'infrastructure de base pour l'utilisation, le partage et la conservation collaborative des connaissances… Lire la suite Wikidata
Combien paye-t-on pour publier en Open Access ? Publication d’un dataset sur les APC demandés par 6 grands éditeurs entre 2019 et 2023
Une équipe du Scholarly Communications Lab a construit un dataset recensant les frais de publication en Open Access (APC, Article Processing Charges) demandés par les revues de 6 grands éditeurs, sur la période 2019-2023 : Elsevier, Frontiers, PLOS, MDPI, Springer Nature et Wiley. Le préprint décrivant le dataset (un bel exemple de data paper) a… Lire la suite Combien paye-t-on pour publier en Open Access ? Publication d’un dataset sur les APC demandés par 6 grands éditeurs entre 2019 et 2023
Ouverture des candidatures pour les prix science ouverte 2024 : logiciel libre, données de la recherche et thèse
Depuis 2022, le ministère de l’Enseignement supérieur et de la Recherche remet les prix science ouverte aux projets qui se distinguent par leurs pratiques de la science ouverte. Deux prix étaient jusque-là décernés, l'un concernant les logiciels libres, l'autre concernant les données de la recherche. Cette année, une troisième catégorie fait son apparition : le… Lire la suite Ouverture des candidatures pour les prix science ouverte 2024 : logiciel libre, données de la recherche et thèse
Déclaration de Barcelone : une prise de décision transparente et de qualité nécessite des informations de recherche ouvertes
Le 16 avril dernier, plus de 30 organisations impliquées dans le financement, l'évaluation ou la réalisation de la recherche ont publié la déclaration de Barcelone sur l'information de recherche ouverte. Ces organisations font le constat que : les prises de décision stratégiques, l'évaluation de la recherche et l'allocation des ressources s'appuient essentiellement sur des infrastructures… Lire la suite Déclaration de Barcelone : une prise de décision transparente et de qualité nécessite des informations de recherche ouvertes
OpenAlex
Si l'on se réfère au preprint déposé dans arXiv en mai 2022, OpenAlex est un graphe de connaissances scientifiques entièrement ouvert, lancé pour remplacer le Microsoft Academic Graph, arrêté depuis le 1er janvier 2022. Nommé en référence à la bibliothèque d'Alexandrie et géré par l'organisation à but non lucratif OurResearch, OpenAlex est aujourd'hui présenté comme… Lire la suite OpenAlex